Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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