Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC37Q16543 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms