Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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