Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RSU1Q15404 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms