Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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