Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAPQ14761 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms