Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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