Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD4Q13485 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD4Q13485 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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