Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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