Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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