Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BPTFQ12830 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BPTFQ12830 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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