Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHHADHQ08426 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms