Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms