Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms