Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GHRH-201ENST00000237527 461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CTD-2270F17.1-201ENST00000518387 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TTC8-204ENST00000354441 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms