Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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IRF8Q02556 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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IRF8Q02556 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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IRF8Q02556 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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IRF8Q02556 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF8Q02556 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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