Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms