Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSF1Q00613 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms