Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms