Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK16Q00536 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms