Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP2C1P98194 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms