Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms