Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms