Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK3P51956 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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