Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC3P51654 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC3P51654 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC3P51654 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms