Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD8P48556 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms