Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms