Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms