Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms