Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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