Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms