Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms