Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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