Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms