Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VCLP18206 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms