Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms