Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRCP08575 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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