Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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