Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR2O75167 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms