Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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