Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXA2O43364 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXA2O43364 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXA2O43364 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXA2O43364 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXA2O43364 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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