Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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