Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms