Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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