Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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