Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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