Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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