Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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