Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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USP35Q9P2H5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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USP35Q9P2H5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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USP35Q9P2H5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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USP35Q9P2H5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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