Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms